Komandant EUFOR-a i komandant NATO Štaba u Sarajeva imaju ovlaštenja da u skladu sa Uputstvom stranama komandanta EUFOR-a, (Izmjena 25 od 1. juna 2008. godine) suspenduju, otpuste iz službe ili spriječe da preuzme bilo koju komandnu ili drugu dužnost, svakog pripadnika Oružanih snaga Bosne i Hercegovine ili Ministarstva odbrane Bosne i Hercegovine koji učestvuju u aktivnostima koje ugrožavaju ili podrivaju mirovni proces.

Prema Općem okvirnom sporazumu za mir, komandant EUFOR-a i komandant NATO Štaba u Sarajevu imaju odgovornost i ovlaštenja da osiguraju da vojna lica u Oružanim snagama BiH tokom cijele svoje karijere budu profesionalna, politički neutralna, podržavaju mirovni proces i ne predstavljaju prijetnju po mir i sigurnost.
Načelnik Zajedničkog štaba Oružanih snaga Bosne i Hercegovine, generalpukovnik Gojko Knežević, kao najodgovorniji u lancu komandovanja unutar OSBiH, odbio je izvršiti naredbu ministra odbrane Bosne i Hercegovine Zukana Heleza koji je zabranio ulazak bjeguncima od bh. pravosuđa Miloradu Dodiku, Nenadu Stevandiću i Radovanu Viškoviću, na sve vojne lokacije OSBiH, uključujući i kasarnu Kozara u Banjoj Luci.
Rušenje ustavnog poretka
Umjesto da izvrši naredbu, general Knežević je 12. maja u kasarni OSBiH dočekao trojac za kojim je Sud Bosne i Hercegovine raspisao centralnu potjernicu zbog sumnje da su počinili krivično djelo - rušenje ustavnog poretka Bosne i Hercegovine. Dodik, Stevandić i Višković se nisu odazvali na poziv Tužilaštva BiH da u svojstvu osumnjičenih daju izjave te im je određen i pritvor.

Članom 5. Zakona o odbrani BiH jasno je precizirano da se "Oružane snage ne mogu koristiti u političke svrhe niti za aktivnosti političkih stranaka".
U članu 84. Zakona o službi u Oružanim snagama stoji:
- Sva vojna lica na službi u Oružanim snagama dužna su da podržavaju i poštuju zakone Bosne i Hercegovine, entiteta i Brčko Distrikta Bosne i Hercegovine. Vojno lice na službi u Oružanim snagama neće preduzimati, usmjeravati niti predlagati aktivnosti za koje se zna, odnosno vjeruje da predstavljaju kršenje postojećih zakona, politika i propisa.

Nakon što je ministar odbrane izdao naredbu, generali OSBiH iz reda srpskog naroda uputili su mu otvoreno pismo.
Pismo su potpisali generalpukovnik Gojko Knežević, načelnik Zajedničkog štaba Oružanih snaga BiH, brigadni general Radovan Јović, zamjenik komandanta Komande za podršku za resurse, brigadni general Nebojša Bošnjak, zamjenik komandanta Operativne komande za operacije, brigadni general Milorad Krajšumović komandant 6. pješadijske brigade.
U svoje antidejtonske i antiustavne aktivnosti, ovim pismom, Dodik i ekipa planski su uvukli i srpske generale, kako bi destabilizirali i urušili Oružane snage BiH.
U članu 22. Zakona o odbrani BiH koji se odnosi na nadležnosti načelnika Zajedničkog štaba OSBiH u okviru lanca komandovanja, između ostalih, stoji:
"Nadgleda i osigurava izvršavanje direktiva i naredbi ministra odbrane", što Knežević nije izvršio, odnosno odbio je osigurati izvršenje naredbe ministra odbrane BiH o zabrani ulaska u kasarnu Kozara Dodiku, Stevandiću i Viškoviću, a kao potpisnik pisma kojim odbija izvršiti naredbu ministra pridružio se antidejtonskim aktivnostima.
General Knežević je ovim činom narušio lanac komandovanja, pokazao neprofesionalizam kao i da nije politički neutralan, što je više nego dovoljno da ga komandant EUFOR-a i komandant NATO Štaba u Sarajevu smijene za mjesta prvog čovjeka Oružanih snaga Bosne i Hercegovine.
General Đukić smijenjen zbog propusta i neuspjeha
Podsjetimo, 2005. godine tadašnji komandanti NATO štaba i EUFOR-a u BiH, smijenili su načelnika Generalštaba Vojske RS-a generala Novaka Đukića (osuđen za ratni zločin na Tuzlanskoj kapiji).
Generali David Leakey i Steven Schook ovakvu odluku donijeli su tada ocijenivši kako je general Đukić odgovoran za propuste koji su se dogodili 16. aprila 2005. godine, kada je veći broj regruta Vojske RS-a na svečanosti davanja zakletve, nju dao Republici Srpskoj umjesto Bosni i Hercegovini.
- General Đukić odgovoran je za neuspjeh u planiranju i komandovanju i zbog toga što VRS nije reagirao brzo i efikasno kako bi se vratilo povjerenje u pouzdanost i ustavnu lojalnost Vojske RS-a. Ti događaji doveli su u pitanje i ustavnu lojalnost i vojnu profesionalnost zapovjednog lanca Vojske Republike Srpske i predstavljaju ozbiljan izazov procesu reforme odbrane - poručili su tada komandanti NATO-a i EUFOR-a.
Novalićeva pisma penzionerima
Ministarstvo finansija Sjedinjenih Američkih Država objavilo je u oktobru 2022. godine da je na njihovu crnu listu stavljen premijer Federacije Bosne i Hercegovine Fadil Novalić.
U saopćenju se navodi da je u svojstvu premijera FBiH Fadil Novalić zloupotrebio podatke o penzionerima u korist vlastite političke stranke, što je suprotno zakonima BiH.
U sedmici prije izbora 2018. godine Novalić je koristio podatke o penzionerima do kojih je došao putem službenog položaja kako bi slao pisma u kojima je naveo svoja postignuća i obećavao povećanje penzija u zemlji u kojoj pitanje penzija ima jaku političku važnost.